The Caligula Effect bercerita tentang dunia virtual bernama “Mobius”, dunia tersebut diciptakan oleh μ yang merupakan seorang idol dari dunia virtual yang memiliki kesadaran dan kecerdasannya sendiri. μ ingin menyelamatkan orang-orang yang malang & menderita dari dunia nyata dan membawanya ke Mobius yang menurutnya adalah tempat paling sempurna bagi mereka. μ membawa orang-orang yang malang dan memancing mereka dengan lagunya kemudian menyeretnya ke Mobius, setelah masuk kedalam dunia virtual tersebut, manusia akan melupakan semua ingatannya tentang dunia nyata dan hidup dalam dunia baru mereka. Apapun kelaminnya dan berapapun umurnya, mereka akan dipaksa menjalani kehidupan didalam Mobius dan menjalani kehidupan baru mereka sebagai seorang murid karena menurut μ masa-masa SMA merupakan masa yang indah bagi manusia.