Conan Movie 28: Sekigan no Flashback Di Gunung Mihodake, Nagano, Kansuke Yamato sedang mengejar seorang buronan ketika tiba-tiba sebuah bayangan melintas dan mengalihkan fokusnya. Dalam hitungan detik, peluru senapan menghantam mata kirinya dan memicu longsor besar yang menimbunnya hidup-hidup. Kansuke berhasil selamat, tapi penglihatannya di mata kiri hilang untuk selamanya.

Hampir setahun setelah kejadian itu, seorang peneliti di Observatorium Astronomi Nasional Nobeyama diserang secara misterius. Kansuke dan Yui langsung meluncur ke lokasi, namun luka di matanya kembali bereaksi hebat tepat saat antena parabola raksasa observatorium mulai beroperasi.

Di waktu yang sama, Kogoro Mouri mendapat panggilan dari mantan koleganya yang dikenal dengan julukan “Wani,” yang sedang membuka kembali investigasi kasus longsor tersebut. Secara aneh, nama Kogoro muncul di dalam berkas penyelidikan. Saat Kogoro dan Conan berangkat untuk menemui Wani, suara tembakan tiba-tiba memecah keheningan…