Goodbye, Don Glees! Cerita berpusat pada dua anak laki-laki bernama Roma dan Toto. Keduanya bertemu ketika Roma pindah dari Tokyo ke pedesaan. Mereka kemudian membentuk duo dengan nama “Don Glees”. Pada musim panas tahun, mereka bertemu Drop, anggota baru Don Gless yang mengajak mereka untuk “melihat dunia dari atas”. Sebuah insiden kecil menjadi hal penting dalam perjalanan yang mengubah hidup mereka.