Kaijin Kaihatsu-bu no Kuroitsu-san cerita berpusat pada Kuroitsu, asisten peneliti di departemen penelitian & pengembangan manusia super Agastya, sebuah organisasi rahasia jahat yang bertempur dengan para pahlawan yang mencoba menyelamatkan dunia. Kuroitsu menjalani kehidupan yang sibuk di Agastya, terjebak di antara permintaan bosnya yang tidak masuk akal; membuat presentasi; mengimplementasikan fitur baru menjadi manusia super; dan mendapatkan hasil dalam waktu, anggaran, dan permintaan spesifikasi yang ditentukan; semua tanpa liburan.

Dengan segala tekanan dan tututan perusahaan tersebut Kuroitsu harus membuat sebuah manusia super yang bisa mengalahkan para pahlawan yang ada. Tapi setiap dia membuat suatu manusia super ada aja masalah yang terjadi dan membuat semuanya menjadi kacau. Kartun komedi yang menggambungkan tokusatsu dan mantebmanteb, lumayan menghibur kalian wkwkw