Metal Fight Beyblade 4D Di Kosmos, sebuah peristiwa yang tidak biasa telah terjadi.

Mengambil istirahat dari kemenangan terbaru mereka atas Faust dan Inti Spiral, Ginga dan Co menemukan diri mereka menyelamatkan seorang anak bernama Yuki dari seorang pemuda misterius bernama Johannes. Meskipun Yuki adalah anak jenius dan astronom, dia adalah Blader yang memiliki “Anubius”.

Yuki mengatakan bahwa dia datang untuk memberi tahu Ginga dan teman-temannya tentang suara Fragmen Bintang. Dia menyaksikan Fragmen Bintang (meteor) jatuh dari langit suatu hari. Cahaya tunggal itu berdiam di dalam Anubius dan dia mengatakan bahwa dia mendengar suara Fragmen Bintang malam itu. Sebuah kejahatan besar sedang mencoba untuk menghidupkan kembali “Matahari Hitam” dan “Nemesis”, dewa kehancuran, dengan menggunakan kekuatan yang tidak diketahui dari Fragmen Bintang dan menghancurkan dunia.

Ginga dan teman-temannya harus bertarung lagi, segera setelah mereka memahami sistem 4D baru mereka!