Vampire Hunter D 10.000 tahun di masa depan, dunia telah menjadi tempat yang sangat berbeda; monster berkeliaran dengan bebas. Dan orang-orang meskipun mereka dilengkapi dengan senjata berteknologi tinggi dan kuda root, kehidupan di jaman itu sama dengan jaman dulu. Ceritanya berfokus pada sebuah desa kecil yang diganggu oleh serangan monster dan hidup di bawah bayang-bayan Count Magnus Lee. Dia merupakan seorang penguasa vampir yang kuat yang telah menguasai negeri itu selama ribuan tahun. Ketika seorang gadis muda di incar oleh Count dan dipilih sebagai mainannya saat ini. Gadis itu mencari bantuan dari orang asing yang sedang melakukan perjalanan bernama D. Kebetulan D adalah salah satu pemburu vampir terbaik di dunia dan menyetujui permintaan gadis itu untuk membantunya. D pun mulai melakukan pembasmian terhadap Count dan para anak buahnya yang kejam.